A fim de gerir as atividades administrativas, o Conselho do departamento elege periodicamente um docente para atuar como chefe do departamento e um suplente. Para auxiliá-lo, o chefe eleito indica membros para as comissões do departamento. A seguir são apresentadas as atribuições do chefe do departamento e das respectivas comissões.

Chefe do departamento

Conforme o Regimento Geral da Universidade de São Paulo, Capítulo IV, Artigo 46, ao Chefe do Departamento compete:

1. convocar e presidir as reuniões do Conselho do Departamento, com direito a voto, além do de qualidade; (alterado pela Resolução nº 6636/2013)
2. representar o Departamento na Congregação e no CTA;
3. exercer o poder disciplinar, sobre os membros dos corpos docente, discente e dos servidores não-docentes, no âmbito do Departamento;
4. providenciar a elaboração do relatório anual das atividades do Departamento, submetendo-o à aprovação do Conselho do Departamento;
5. supervisionar e orientar as atividades do pessoal docente, técnico e administrativo do Departamento;
6. zelar pela regularidade do ensino das disciplinas ministradas pelo Departamento;
7. zelar pelo cumprimento da legislação referente aos regimes de trabalho do corpo docente;
8. exercer as demais atribuições que lhe forem conferidas por este regimento e pelo regimento da Unidade.

Comissões

Avaliação Docente

Emitir pareceres sobre os docentes no que concerne a credenciamento CERT, período probatório, mudança de regime (RTP/RTC para RDIDP).

Biblioteca

Representar o departamento na comissão de biblioteca da USP. Divulgar as informações e orientar o departamento sobre as atividades da comissão de biblioteca.

Cursos (CoC)

Tratar de todos os assuntos relacionados ao curso de graduação em Engenharia Mecatrônica da Escola Politécnica da USP.

Extensão

Representar o departamento na comissão de extensão da Escola Politécnica USP. Divulgar as informações e orienta o departamento sobre as atividades de extensão.

Graduação do PMR para a CG da Escola Politécnica da USP

Representar o departamento da comissão de graduação da Escola Politécnica da USP. Esse membro deve pertencer à CoC.

Informática

Tratar de todos os assuntos relacionados a informática no departamento.

Oficina

Tratar de todos os assuntos relacionados à oficina no departamento.

Pesquisa

Representar o departamento da comissão de pesquisa da Escola Politécnica da USP. Divulgar as informações e orientar o departamento sobre as atividades de pesquisa.

Pós Graduação

Representar o departamento da comissão de pós-graduação da Escola Politécnica da USP. Divulgar as informações e orientar o departamento sobre as atividades de pós-graduação. Esse membro deve pertencer à CCP.